法人名義の自動車でも、出張封印できますか?

はい、できます。個人ユーザー、法人ユーザーに関わりなく出張封印は可能です。
ただし、所有者が自動車販売業者になっている移転登録及び変更登録の場合は、出張封印を行うことが出来ません。